הגורמים הביולוגיים הקובעים מיניות הגורם הראשון בקביעת המיניות הוא המטען הגנטי. כרומוזום - רצף של מולקולות שנקרא DNA המכיל את האינפורמציה הגנטית. החומר הגנטי שוכן בתוך הגרעין של כל אחד מתאי הגוף שלנו. על פי האינפורמציה שעל הכרומוזומים, מייצר הגוף את החלבונים הדרושים לו, והם אלה שקובעים את התהליכים המתרחשים בגופינו. הם שקובעים את צבע העיניים, סוג שיער, מבנה גוף, גובה וכו'. לבני האדם 46 כרומוזומים המסודרים ב- 23 זוגות. אחד מזוגות הכרומוזומים קובעים את המין של אותו אדם. לאישה שני כרומוזומי X ונוהגים לסמן זאת כ- XX , ואילו לגבר כרומוזום אחד X והשני Y. בתהליך הרבייה תורם כל אחד מההורים כרומוזום מין אחד. האימא תמיד תורמת X ואילו האב יכול לתרום X או Y. אם העובר יקבל X משני המינים, תיוולד ילדה, ואם הוא יקבל X מהאימא ו- Y מהאב, יולד בן. ובניגוד לדעות קדומות רווחות, מי שקובע את המין של הילד הוא הגבר ולא האישה. (ציור XY). תיאורטית, הסיכוי להולדת בנים ובנות הוא זהה. למעשה, בארה״ב נמצא כי על כל 100 תינוקות בנות נולדים 105 בנים. אף על פי כן, שיעור הנשים באוכלוסייה הוא 51. נוטים לייחס זאת לכך שגברים רגישים יותר למחלות מאשר נשים, שיעור התמותה שלהם גבוהה יותר, והם מתים בגיל צעיר יותר ביחס לנשים. חלק מהסיבה לכך שגברים רגישים יותר למחלות נובעת מהעובדה שיש להם כרומוזום Y. העובדה כי לנשים יש מלכתחילה חומר גנטי כפול, שומרת עליהם במקרה של טעויות גנטיות באחד הכרומוזומים. כמו כן, ברגע שיש טעות גנטית על כרומוזום Y היא עוברת לדור הבא ובאה לידי ביטוי רק אצל בנים.
מה משמעות העובדה אם יש לאדם כרומוזום XX או YX? הגנים על כרומוזום Y אחראים על התפתחות אשכים בזמן ההתפתחות העוברית. האשכים והשחלות מתפתחים מאותה רקמה עוברית. אם יש שני כרומוזומי XX יתפתחו שחלות (ברירת המחדל). נוכחות כרומוזום Y היא זו שגורמת לכך שיתפתחו אשכים במקום שחלות. עם התפתחות העובר, ההורמונים שמופרשים מהשחלות או האשכים הם אלה שיוצרים מאפיינים פיזיולוגיים אחרים, כגון התפתחות איברי מין חיצוניים, שיער פנים, חזה ושאר המאפיינים המבדילים בין גברים ונשים.
